Действието във филма се развива 15 години след последния сезон на първия сериал "Мисия невъзможна". Вторият сериал описва мисиите на екип от тайни агенти на американското правителство, наречен "Отряд за невъзможни мисии". След като един от първоначалните шефове бива убит, пенсионираният Джим Фелпс е призован на помощ, за да може новият екип на Отряда за невъзможни мисии да залови убиеца и да въдвори справедливост.