A Csillagkapu: Atlantisz 2004. július 16-án került adásba az amerikai Sci-Fi csatornán, mint a Csillagkapu sorozat hivatalos spin-off sorozata. A legelső két részt Rising/Felemelkedés címmel mozifilmszerűen, egyben adták le, és a Sci-Fi minden addigi nézettségi rekordját megdöntötte.
A spin-off eseményei a Csillagkapu hetedik évadjának záró duplarészét követik (The Lost City/Az Elveszett Város), amely során a CSK-1 az Ősök (más néven Kapuépítők) Elveszett Városa, Atlantisz után kutatva egy idegen építményre bukkan az Antarktisz jege alatt.
A Csillagkapu: Atlantisz nyitó duplarészében a Csillagkapu Parancsnokság által indított új expedíció megtalálja Atlantiszt, de nem a Földön, hanem a távoli Pegazus-galaxisban. Hamar kiderül azonban, hogy nem térhetnek haza, így egyedül kell szembenézniük azzal az ősi, és gonosz ellenséggel, amely évezredekkel ezelőtt még az Ősöket is legyőzte.