Fumizuki is een heel bijzondere school die haar leerlingen in zes klassen verdeelt op basis van hun score op een examen. De middelbare scholieren met de beste resultaten gaan naar klas A, waar maximaal studiecomfort verzekerd is, terwijl de minst efficiënte naar klas F worden gestuurd, de meest onhygiënische.
Akihisa Yoshii hoopt, ondanks dat ze een van de slechtste leerlingen is, de opdracht te halen om zo de hoogst mogelijke klas te bereiken. Tijdens dit laatste verspilt hij echter tijd om een van zijn klasgenoten, Himeji genaamd, te helpen, die uiteindelijk flauwvalt. Als gevolg hiervan bevinden zij en Yoshii zich samen in klasse F. Geconfronteerd met de erbarmelijke arbeidsomstandigheden besluit klasse F een opstand te beginnen.